Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms