Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms