Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ropn1lQ9EQ00 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms