Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cpsf1Q9EPU4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf1Q9EPU4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms