Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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