Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmpcaQ9DC61 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmpcaQ9DC61 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmpcaQ9DC61 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmpcaQ9DC61 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmpcaQ9DC61 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmpcaQ9DC61 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmpcaQ9DC61 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmpcaQ9DC61 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmpcaQ9DC61 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmpcaQ9DC61 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmpcaQ9DC61 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmpcaQ9DC61 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmpcaQ9DC61 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms