Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms