Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms