Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Swt1Q9DBQ9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms