Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkar1aQ9DBC7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms