Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Smg9Q9DB90 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Smg9Q9DB90 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Smg9Q9DB90 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Smg9Q9DB90 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Smg9Q9DB90 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Smg9Q9DB90 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms