Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAV9

Tmem38b, Trimeric intracellular cation channel type B, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38bQ9DAV9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem38bQ9DAV9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem38bQ9DAV9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms