Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms