Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmbim4Q9DA39 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms