Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smco2Q9DA21 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms