Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms