Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph9Q9D9V4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms