Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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