Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Rnf138rt1Q9D9M9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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