Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms