Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rexo2Q9D8S4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms