Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Derl3Q9D8K3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms