Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms