Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmigd1Q9D7L8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms