Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms