Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms