Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc3Q9D6Y1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc3Q9D6Y1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms