Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Borcs6Q9D6W8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms