Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms