Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23bQ9D662 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms