Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt34Q9D646 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms