Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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Rab11fip1Q9D620 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
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Rab11fip1Q9D620 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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Rab11fip1Q9D620 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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Rab11fip1Q9D620 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Rab11fip1Q9D620 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Rab11fip1Q9D620 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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