Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpcat2bQ9D5U0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Lpcat2bQ9D5U0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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