Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms