Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930449I24RikQ9D5E3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms