Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms