Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl3Q9D4V7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms