Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms