Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms