Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms