Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubgcp4Q9D4F8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms