Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms