Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpn3Q9D3W4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms