Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms