Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Krt20Q9D312 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms