Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X0

Ankrd39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39Q9D2X0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ankrd39Q9D2X0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ankrd39Q9D2X0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms