Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef12Q9D2F1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms