Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms