Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krtap5-3Q9D226 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms