Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mrpl28Q9D1B9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms